El Laboratorio tiene como principal campo temático de interés el desarrollo de estudios sobre comportamiento químico, residualidad y destino de  residuos y contaminantes químicos (residuos de plaguicidas y fármacos de uso veterinario, contaminantes ambientales como PCBs, elementos traza de riesgo tóxico como Pb, Cd, Cr, As, Hg entre otros),  en los alimentos (leche, carne, miel, vegetales) y en el ambiente (agua, sedimentos, suelos) mediante el empleo de instrumental, recursos humanos y estructura de laboratorio en un nivel referencial.

Desde sus inicios como laboratorio de residuos y contaminantes en niveles vestigiales, el LCSA debió utilizar sistemas de QA/QC (aseguramiento de la calidad/control de la calidad) para producir información analítica confiable. Por ello es un laboratorio que aplica normas de calidad desde 1983 y participa activamente en la enseñanza universitaria en los niveles de grado y posgrado en este tema, con mayor énfasis desde 1995.